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進行淤積河段清疏工程，過程中或因各種人為疏失致執行不當，進而造成二次災害，包括清疏土石處理、土方堆置區未保護、水理計算有誤等問題。為能有效避免，同時提升執行成效，藉由野溪清疏專案管理計畫，透過專業技師協助工程進行及稽查工程內容與品質。

中下游地區多為農業發展重要地區，故農作安全及灌溉用水供給需求極為重要，其主要特性為土砂淤積量小、點位多，因此以區域性清疏工程進行清疏，並經由專案管理計畫，有效利用遞減經費，提升野溪清疏工程效益，整治績效良好，可有效降低洪水土砂災害，避免影響農業灌溉用水供給需求，明顯降低工程經費，降低農作災害經濟損失，清疏成效可維持至少5年以上，同時保障民眾生命財產安全， 增加地區居民對清疏工之認同感。